Estos compuestos presentan la misma cadena o anillo y los mismos grupos funcionales, pero difieren en la posicón o posiciones a las cuales estan unidos esos grupos , por lo que las propiedades fisicas e incluso las químicas varían.

Los grupos funcionales de unos compuestos, se unen de diferentes posiciones.
Este tipo de isomería es la molécula del pentanol, donde es 3- pentanol.
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